Genòmica Translacional
Programa de recerca
Caps de grup
On som
Hospital Sant Joan de Déu Barcelona
Webs relacionades
Hospital Sant Joan de Déu Barcelona El grup de Genòmica Translacional integra la capacitat científica en el camp de la genòmica i bioinformàtica amb l'experiència i el coneixement de les alteracions genètiques específiques i el context clínic dels tumors sòlids pediàtrics. D'aquesta manera el grup ha desenvolupat projectes d'investigació enfocats a l'estudi de les diferents alteracions genètiques i epigenètiques subjacents a el comportament clínic-patològic dels tumors pediàtrics, per tal d'identificar nous biomarcadors i dianes terapèutiques que permetin avançar en el tractament i el maneig clínic dels pacients.
Des de l'any 2014 pertanyem a un grup consolidat de recerca AGAUR (Generalitat de Catalunya, Referència 2017 SGR 1672).
Línies de recerca
- Estudi de les implicacions funcionals i clíniques dels canvis de metilació de l'ADN.
- Desenvolupament de marcadors epigenètics per a la classificació molecular dels tumors pediàtrics.
- Desenvolupament d'una plataforma digital per a la classificació molecular dels tumors pediàtrics.
- Estudi de l'epigenètica en la patogènesi del Neuroblastoma.
- Desenvolupament de biomarcadors de resposta a tractament en Neuroblastoma.
Objectius científics
- Desenvolupament i validació de biomarcadors (epi-) genètics per a la millora tant de la diagnosi com la determinació del pronòstic i el seguiment de la malaltia.
- Investigar la possibilitat d'utilitzar biomarcadors (epi-) genètics en líquids corporals (biòpsia líquida) de pacients com a marcadors moleculars no invasius per al diagnòstic, el seguiment de la malaltia i la resposta a tractament.
- Desenvolupament d'eines per a la implementació de nous biomarcadors en la pràctica clínica.
- Investigar les implicacions funcionals i clíniques dels canvis (epi-) genètics implicats en el comportament clínic-patològic dels tumors del desenvolupament, per tal d'identificar potencials dianes terapèutiques.
Àmbit/Camp d'especialització
Anàlisi de les alteracions genètiques específiques dels tumors sòlids pediàtrics. Coneixement clínic per posar en context les dades moleculars.
Experiència en el camp de la genòmica i bioinformàtica funcional.
Desenvolupament i validació de biomarcadors per a la classificació dels pacients, determinació de pronòstic i resposta a tractament dels tumors sòlids pediàtrics.
Experiència en el disseny d'eines d'anàlisi pròpies.
Membres del grup
-
Jefe de Grupo Senior
-
Investigador post-doc
-
Investigador pre-doc
-
Técnico
-
Investigador
-
Investigador post-doc
Últimes publicacions
- Solana MJ, Manrique G, Fernández R, Slocker M, Garcia-López M, Redondo S, Yun C, Gil R, Balaguer M, Rodríguez E, González-Posada A, Santiago C, Martín CM, Miñambres M, Sánchez M, Goñi C, López J and López-Herce J Nutritional status and nutrition support in critically ill children in Spain: Results of a multicentric study Nutrition . 84: 110993-110993.
- Mohammad F, Weissmann S, Leblanc B, Pandey DP, Højfeldt JW, Comet I, Zheng C, Johansen JV, Rapin N, Porse BT, Tvardovskiy A, Jensen ON, Gene-Olaciregui N, Lavarino C, Suñol M, de Torres C, Mora J, Montero-Carcaboso A and Helin K EZH2 is a potential therapeutic target for H3K27M-mutant pediatric gliomas NATURE MEDICINE . 23(4): 483-492.
- Filbin MG, Tirosh I, Hovestadt V, Shaw ML, Escalante LE, Mathewson ND, Neftel C, Frank N, Pelton K, Hebert CM, Haberler C, Yizhak K, Gojo J, Egervari K, Mount C, van Galen P, Bonal DM, Nguyen QD, Beck A, Sinai C, Czech T, Dorfer C, Goumnerova L, Lavarino C, Montero-Carcaboso A, Mora J, Mylvaganam R, Luo CC, Peyrl A, Popovic M, Azizi A, Batchelor TT, Frosch MP, Martinez-Lage M, Kieran MW, Bandopadhayay P, Beroukhim R, Fritsch G, Getz G, Rozenblatt-Rosen O, Wucherpfennig KW, Louis DN, Monje M, Slavc I, Ligon KL, Golub TR, Regev A, Bernstein BE and Suvà ML Developmental and oncogenic programs in H3K27M gliomas dissected by single-cell RNA-seq. Science . 360(6386): 331-335.
Projectes
- Nom del projecte:
- Desarrollo de clasificadores epigenéticos para el Cáncer Pediátrico (ECPC)
- Investigador/a principal
- Cinzia Emilia Lavarino
- Entitat/es finançadora/es:
- Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
- Codi
- PI20/00519
- Data de inici-fi:
- 2021 - 2023
- Nom del projecte:
- Platform of Epigenetic Classifiers for Childhood CAncer (PECA)
- Investigador/a principal
- Cinzia Emilia Lavarino
- Entitat/es finançadora/es:
- Fundació La Marató de TV3
- Codi
- 201921-30
- Data de inici-fi:
- 2020 - 2023
- Nom del projecte:
- Método para la clasificación en subgrupos moleculares de pacientes con Meduloblastoma
- Investigador/a principal
- Cinzia Emilia Lavarino
- Entitat/es finançadora/es:
- Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
- Codi
- PI17/00353
- Data de inici-fi:
- 2018 - 2021
Tesis
-
Combined therapies for neuroblastoma based on the activation of the calcium sensing receptor
- Autor
- Gonçalves Alves, Eliana Carolina
- Organisme
- UNIVERSIDAD DE BARCELONA
-
Developmental Tumors, Epigenetics and microRNAs.
- Autor
- Gomez Gonzalez, Soledad
- Organisme
- UNIVERSIDAD DE BARCELONA
Notícies
-
La Marató de TV3 2019 finança quatre projectes de recerca en oncologia pediàtrica
Investigadors de l'Institut de Recerca Sant Joan de Déu · Hospital Sant Joan de Déu Barcelona han rebut finançament de La Marató de TV3 2018 per a desenvolupar 4 projectes de recerca científica en l'àmbit del càncer pediàtric.
Els Drs. Jaume Mora, Cinzia Lavarino i Angel Montero lideren 3 dels 43 projectes escollits; i la Dra. Silvia Mateo participa en un projecte liderat per l'IDIBELL.
-
El subgrup molecular del medul·loblastoma del pacient: element clau per al tractament personalitzat
Les Dres. Cinzia Lavarino i Soledad Gómez, ambdues investigadores de l'Institut de Recerca Sant Joan de Déu i el Laboratori de Tumors del Desenvolupament de l'Hospital Sant Joan de Déu, han dissenyat una nova metodologia per a classificar els medul·loblastomes pediàtrics de forma més ràpida, precisa i senzilla i, que, a més estarà a l'abast de molts centres hospitalaris.
El medul·loblastoma és el tumor cerebral maligne més comú en l'edat pediàtrica, i representa actualment el 20% dels tumors en nens.
-
"Descobrir la cèl·lula embrionària d'origen en els tumors pediàtrics és clau per avançar"
Així ho conclou un estudi publicat a Science sobre el glioma difús de línia mitja centrat en la protuberància (DIPG), on han participat els Drs. Jaume Mora, Cinzia Lavarino i Angel Montero, investigadors del Laboratori de Tumors del Desenvolupament de l'Hospital Sant Joan de Déu i l'Institut de Recerca Sant Joan de Déu, juntament amb professionals dels Estats Units, Israel, Àustria, Suïssa i Eslovènia.