Malalties infeccioses i microbioma
Programa de recerca
Caps de grup
On som
Hospital Sant Joan de Déu Barcelona
Webs relacionades
Hospital Sant Joan de Déu Barcelona El nostre grup de recerca està orientat a l'estudi dels aspectes clínics, moleculars, epidemiològics i millora de la diagnosi de les principals malalties infeccioses pediàtriques.
Des de l'any 2016 formem part del CIBERESP, a més de ser reconeguts com a grup consolidat de Recerca AGAUR (Generalitat de Catalunya, 2017/SGR/742) des del 2009.
Línies de recerca
- Vigilància epidemiològica molecular de les malalties prevenibles per vacunació. Realitzem estudis d'avaluació de les vacunes contra infeccions prevalents en la infància així com caracterització molecular dels principals clons causants de malaltia.
- Malalties de transmissió vertical, orientada a augmentar els coneixements en història natural, el diagnòstic pronòstic i el tractament de les infeccions transmeses de mare a fill.
- Tuberculosi amb l'objectiu d'investigar l'adherència i toxicitat associada als fàrmacs antituberculosos de primera línia i les característiques clínic-epidemiològiques de la tuberculosi en la infància.
- Microbioma humà. La línia analitza el desenvolupament del microbioma humà en l'edat pediàtrica i la relació dels diferents perfils de microbiota segons variables clíniques i epidemiològiques.
- Innovació diagnòstica, orientada al disseny i avaluació de noves tècniques de diagnòstic microbiològic ràpides, precises i de baix cost
Objectius científics
- Conèixer l'evolució de la malaltia pneumocòccica invasiva pediàtrica després de la introducció de la vacuna conjugada antipneumocòccica tridecavalente en el calendari sistemàtic.
- Analitzar l'efectivitat de la vacuna contra la tos ferina en dones embarassades en el tercer trimestre per prevenir la tos ferina.
- Investigar les associacions entre la composició de la microbiota nasofaríngia i les característiques clíniques, epidemiològiques i microbiològiques dels lactants menors d'un any amb diagnòstic clínic de tos ferina.
- Analitzar els factors associats a la composició de la microbiota nasofaríngia i el seu paper com a marcador diferencial entre pneumònia bacteriana o infecció viral respiratòria en nens.
- Identificar en nens menors de cinc anys una microbiota de risc per presentar infecció respiratòria greu per rinovirus.
- Desenvolupament i validació d'un assaig de metagenòmica clínica basada en la seqüenciació de nova generació no dirigida (mNGS) per a la identificació ràpida, simple, precisa i assequible dels patògens causants de sèpsia i meningitis.
Àmbit/Camp d'especialització
La recerca que desenvolupa el nostre grup s'emmarca en l'estudi dels aspectes clínics, microbiològics, moleculars i terapèutics de les malalties infeccioses pediàtriques. Es tracta d'un equip multidisciplinari compost per investigadors especialitzats en pediatria, microbiologia, bioinformàtica, bioestadística i gestió. Un dels grans reptes del grup és l'estudi del microbioma humà i la innovació diagnostica en les malalties infeccioses mitjançant l'ús de la seqüenciació massiva de nova generació. Aquesta nova activitat es combina amb una trajectòria consolidada de les diferents línies en què treballem.
Membres del grup
-
Investigador
-
Técnico
-
Investigador post-doc
-
Mariona Fernández De Sevilla Estrach
Investigador post-doc
-
Investigador
-
Investigador pre-doc
-
Ayudante de investigación
-
Investigador
-
Jefe de Grupo Senior
-
Técnico
-
Investigador pre-doc
-
Técnico
-
Investigador pre-doc
-
Investigador
-
Investigador
-
Investigador colaborador
-
Investigador
-
Investigador
-
Investigador
-
Investigador pre-doc
-
Investigador pre-doc
-
Ayudante de investigación
-
Investigador post-doc
-
Quique Bassat
Investigador colaborador
-
Investigador pre-doc
-
Ayudante de investigación
Últimes publicacions
- Bamford A, Turkova A, Lyall H, Foster C, Klein N, Bastiaans D, Burger D, Bernadi S, Butler K, Chiappini E, Clayden P, Della Negra M, Giacomet V, Giaquinto C, Gibb D, Galli L, Hainaut M, Koros M, Marques L, Nastouli E, Niehues T, Noguera-Julián A, Rojo P, Rudin C, Scherpbier H, Tudor-Williams G and Welch S Paediatric European Network for Treatment of AIDS (PENTA) guidelines for treatment of paediatric HIV-1 infection 2015: optimizing health in preparation for adult life. HIV MEDICINE . 19(1): 1-42.
- European Pregnancy and Paediatric HIV Cohort Collaboration (EPPICC) study group , Chiappini E, Ene L, Galli L, Giaquinto C, Goetghebuer T, Judd A, Malyuta R, Noguera-Julián A, Ramos-Amador JT, Rojo-Conejo P, Rudin C, Tookey P and Lisi C Severe haematologic toxicity is rare in high risk HIV-exposed infants receiving combination neonatal prophylaxis. HIV MEDICINE . 20(5): 291-307.
- Valero-Rello A, Henares-Bonilla D, Acosta L, Jane M, Jordán-García I, Godoy P and Munoz-Almagro C Validation and Implementation of a Diagnostic Algorithm for DNA Detection of Bordetella pertussis, B. parapertussis, and B. holmesii in a Pediatric Referral Hospital in Barcelona, Spain. JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY . 57(1): e01231.
Projectes
- Nom del projecte:
- Contratos predoctorales de formación en investigación en salud (PFIS). Beneficiari: María Rios
- Investigador/a principal
- Antoni Noguera Julián
- Entitat/es finançadora/es:
- Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
- Codi
- FI20/00237
- Data de inici-fi:
- 2021 - 2025
- Nom del projecte:
- Tecnologías NGS para la Vigilancia Epidemiológica Molecular de S. pneumoniae y para determinar su invasividad. Quo vadis y Quo invades pneumococcus?
- Investigador/a principal
- Carmen Muñoz Almagro
- Entitat/es finançadora/es:
- Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
- Codi
- PI19/00104
- Data de inici-fi:
- 2020 - 2022
- Nom del projecte:
- Plataforma Kids Corona Casal
- Investigador/a principal
- Juan José García García
- Entitat/es finançadora/es:
- Clientes Diversos
- Codi
- PFNR0141
- Data de inici-fi:
- 2020 - 2021
Tesis
-
Pneumococcal adaptation during invasion
- Organisme
- Universidade Nova de Lisboa
-
Utilidad de las técnicas de inmunodiagnóstico de la infección tuberculosa en niños menores de 5 años
- Autor
- Velasco, Eneritz
- Organisme
- UNIVERSIDAD DE BARCELONA
-
Clinical and microbiological epidemiology of Streptococcus pneumoniae among children in Mozambique before and after pneumococcal conjugate vaccine introduction.
- Organisme
- UNIVERSIDAD DE BARCELONA
Notícies
-
Dos articles de l'IRSJD obtenen els premis a la recerca 2021 de l'Hospital Sant Joan de Déu Barcelona
Els articles liderats per les investigadores Carmen Muñoz Almagro i Núria Herranz s’enduen els premis a les millors publicacions científiques en els premis a la recerca 2021 de l’Hospital Sant Joan de Déu Barcelona.
-
La digitalització dels assaigs clínics
Hospitals i indústria farmacèutica avancen junts en la digitalització dels assaigs clínics sota la premissa el pacient com a gestor de les seves dades.
-
Epidemiologia de la malaltia infecciosa per Streptococcus pyogenes en població pediàtrica
En l'estudi es fa un anàlisi de l'epidemiologia de la infecció per Streptococcus pyogenes en la població pediàtrica de dues regions d'Espanya (Catalunya i Gipuzkoa) durant 12 anys.