Epigenética del Cáncer Pediátrico

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Cáncer pediátrico

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Hospital Sant Joan de Déu Barcelona

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Los tumores del desarrollo son biológicamente distintos de los cánceres de adultos: no muestran altos niveles de acumulación mutacional, sino que se caracterizan por una desregulación epigenética. En el grupo Epigenética del Cáncer Pediátrico hacemos preguntas fundamentales sobre la biología de los tumores del desarrollo: ¿Cómo conduce la desregulación epigenética en la cancerogénesis? ¿Qué células progenitoras son susceptibles de transformación maligna impulsada por la epigenética? ¿Qué hace que estos progenitores sean especialmente susceptibles y se puede revertir su transformación?

Nuestro objetivo general es identificar las vulnerabilidades epigenómicas específicas de los tumores del desarrollo y explotarlas en la búsqueda de terapias personalizadas para mejorar el bienestar y el pronóstico del paciente. Creemos que una talla no sirve para todos, y debemos tratar al individuo, no a la enfermedad.

El grupo se centra principalmente en los tumores rabdoides malignos (MRT): cánceres pediátricos altamente malignos y heterogéneos, caracterizados por la activación bialélica de la subunidad SMARCB1 del complejo remodelador de cromatina SWI/SNF. La pérdida funcional de SMARCB1 es la única alteración recurrente en los MRT, lo que los convierte en el ejemplo más puro de tumorigénesis impulsada epigenéticamente hasta la fecha.

Líneas de investigación

  1. El epigenoma de los MRT se altera como resultado de la pérdida funcional de SMARCB1. Sin embargo, se desconoce cuál de los numerosos cambios es responsable de la transformación maligna. Usando enfoques (epi) genómicos y edición de genes, estamos separando los cambios epigenómicos que impulsan la transformación maligna de aquellos que son meros espectadores. Con este conocimiento, enfocaremos el desarrollo terapéutico para apuntar a los impulsores de esta enfermedad.
  2. Los MRT son una enfermedad muy heterogénea que puede surgir en múltiples órganos. Sin embargo, las células de origen de la enfermedad siguen siendo enigmáticas. Utilizando métodos de rastreo de linaje y biología computacional, estamos investigando los orígenes de diferentes subtipos de MRT.
  3. Algunos MRT tienen un abundante infiltrado de células inmunitarias, mientras que otros son completamente inmunes al frío. Estamos investigando la fuente de inmunogenicidad en los tumores MRT y evaluando cómo podría aprovecharse para el tratamiento (por ejemplo, mediante inmunoterapia).

Objetivos científicos

  1. Caracterizar la heterogeneidad de la enfermedad de MRT en los niveles celular, transcriptómico y epigenético para ayudar a la subclasificación de la enfermedad y la estratificación de los pacientes.
  2. Identificar las aberraciones epigenómicas de los MRT que causan la transformación maligna.
  3. Evaluar si las alteraciones epigenómicas "transeúntes" podrían explotarse terapéuticamente.
  4. Identificar la célula de origen de diferentes subtipos de MRT.
  5. Identifcar la fuente de inmunogenicidad en subconjuntos de MRT y evaluar si se puede explotar terapéuticamente.
  6. Evaluar cómo la focalización epigenética puede establecer sinergias con el tratamiento estándar de atención para mejorar el pronóstico del paciente.

Àmbit/Camp d'especialització

Nuestro trabajo se basa en la multidisciplinariedad, promoviendo la integración de técnicas de biología celular y molecular, rastreo de linajes, edición del genoma CRISPR / Cas9, citometría, microscopía, genómica del cáncer (epi) y biología computacional. Nuestro equipo tiene una amplia experiencia en enfoques de biología experimental y computacional.

La estrecha asociación entre el IRSJD y el Hospital Sant Joan de Déu Barcelona tiene como objetivo cerrar la brecha entre el laboratorio y la cama, con el objetivo en última instancia de identificar nuevos puntos de intervención terapéutica para mejorar el pronóstico y el bienestar del paciente.

Miembros del grupo

Proyectos

Nombre del proyecto:
El epigenoma malvado de los tumores rabdoides - definir para tratar.
Investigador/a principal
Alexandra Avgustinova
Entidad/es financiadora/as:
Ministerio de Economía Y Competitividad (MINECO)
Código
PID2020-118241RA-I00
Fecha de inicio-fin:
2021 - 2024
Nombre del proyecto:
Ayudas para contratos Ramón y Cajal (RYC) 2019. Beneficiario: Alexandra Avgustinova
Investigador/a principal
Alexandra Avgustinova
Entidad/es financiadora/as:
Ministerio de Economía Y Competitividad (MINECO)
Código
RYC2019-027738-I
Fecha de inicio-fin:
2020 - 2025
Más proyectos